Såfremt der er institutioner, der ikke har nået at få lavet en ny IndFak-opsætning, vil der først i det nye år blive oprettet nye EAN-numre til institutionen, så det sikres, at 2012-fakturaer kan opsamles adskilt fra 2011-fakturaer. Det er vigtigt, at institutionen efterfølgende meddeler nye EAN-numre til leverandørerne, så fakturaer fremsendes til den nye institutions IndFak-løsning, som senere vil kunne udarbejdes endeligt.
Hvis institutioner har 2012-fakturaer, der er opsamlet i den gamle IndFak-løsning, dvs. på det gamle EAN-nummer, er der to muligheder. Institutionen kan printe fakturaerne ud og indtaste dem manuelt i den nye løsning, så snart denne er oprettet, men hvis man kan få sine leverandører til at genfremsende fakturaer til de nye EAN-numre, er dette at foretrække. På denne måde sikres, at det endelige IndFak indeholder alle 2012-fakturaer.